Первые люди появились на этой территории ещё в каменном веке. Во многих местах до сих пор сохранились древние дольмены и стоянки первобытного человека. В VI веке на территории, которая сегодня является графством Клэр, пришли христианские монахи-проповедники. Большинство монастырей расположилось вокруг озера Дерг, однако в IX веке они очень сильно пострадали от частых набегов викингов и были, в большинстве своём, разграблены. В средние века, самым могущественным и сильным кланом в Клэре были О`Брианы. К XII веку представители этого семейства контролировали большую часть Ирландии, в том числе территории современных графств Лимерик, Клэр, Северный Типперэри и Оффали. Член клана — Бриан Бору принял титул Верховного короля Ирландии. Однако, к XIII веку власть О`Брианов ослабла — военные действия против норманнов и англичан уже не заканчивались успешно. Территория Клэра сократилась и была включена в британский доминион. В 1650-е годы началось крупномасштабное переселение колонистов из других частей Ирландии, а также из Англии. Здесь окончательно закрепилось британское господство. В первой половине XIX века население провинции неуклонно росло, и достигло 208 тыс. человек, однако частые неурожаи и Великий голод 1845—1849 годов стали причиной массовой эмиграции жителей графства в США. Впоследствии эта тенденция привела к тому, что в 1966 году население Клэра сократилось до 73,5 тыс.