Единственный в Вологодской области международный аэропорт «Череповец» расположился всего в 25 км от города Череповца. Ежедневно выполняется вылет и посадка чартерных и регулярных рейсов в разные города России и Зарубежья.

7 февраля1923 года была образована Череповецкая пристань в составе Северо-Западного речного пароходства. Территория Череповецкой пристани представляла остров, отделенный от города рекой Ягорбой, рекой Шексной, а с востока искусственно созданной гаванью, которая соединялась с рекой Ягорбой при помощи деревянного шлюза длиной 60 метров. Для обработки пассажирских судов имелся деревянный однодечный дебаркадер, установленный на правом берегу р. Шексны, связанный с городом шоссейной дорогой и мостом через реку Ягорбу в районе Соборной горки. Он использовался в качестве пассажирского вокзала. В 1960-1964 годах по проекту Ленгипроречтранса были проведены работы по реконструкции порта. В 1997 году после реструктуризации ОАО «Северо-Западное пароходство» Череповецкий порт выделен в дочернее ОАО «Череповецкий порт». С 1 марта 2002 года из ОАО «Череповецкий порт» подразделение, занимавшееся ранее пассажирскими перевозками, выделено в самостоятельное ООО «Череповецкий пассажирский порт». Этому подразделению передан пассажирский флот, причалы, дебаркадеры. Адрес: г. Череповец, Соборная горка, речной вокзал.

Автомобильный вантовый мост через Шексну в Череповце, соединяющий Индустриальный и Зашекснинский районы. Мост был открыт в 1979 году и является первым вантовым мостом, построенным на территории России. По конструкции мост схож с мостом Святого Северина через Рейн в немецком Кёльне.