Выставка "Из истории медицины города Ярославля" состоит из трех тематических залов. В первом из них представлены экспонаты, которые фиксируют накопление медицинских знаний. Особое внимание привлекают комплексы «Изба знахаря» и "Келья монаха".

Экспонаты второго зала рассказывают об истории первых лечебных учреждений города Ярославля, именитых врачах города. Кроме фотографий, документов в витринах и на подиумах выставлены медицинские инструменты. Среди них – бормашина конца XIX века.

Третий зал экспозиции хронологически связан с советским периодом истории города. Экспонаты, размещенные на стендах и в витринах, посвящены появлению в городе новых больниц, работе выдающихся ярославских медиков. Особое внимание обращено на работу врачей в годы Великой Отечественной войны: как на фронте, так и в тылу врага.

Завершается экспозиция показом современных медицинских технологий, деятельности крупных медицинских центров. На нескольких стендах представлена история медицинского образования. На фотографиях выпускники Ярославского медицинского института. Рядом портреты выдающихся ученых-медиков.