На протяжении многих лет фонд музея в Каире пополняли различные археологические находки. Коптский музей в Каире насчитывает 29 залов (наибольшее число среди всех музеев Египта), которые расположены в старом и новом флигелях, где предоставлены различные предметы культуры и быта коптов. Отличается особой оригинальностью интерьера старый флигель: потолки расписаны идеальной египетской росписью, на окнах красивые резные деревянные панели, а во дворе музея необычайные фонтанчики. Здесь насчитывается около 1200 экспонатов: старинные манускрипты и папирусы, деревянное панно, ткани и вышивка, большая коллекция икон, фрески и лепнина, оружие, золотые монеты.